Rekonstrukce bude trvat více než rok a kromě vzniku nových expozic je hlavním cílem zlepšení podmínek uchování sbírkového fondu muzea. 

Návštěvníci se mohou těšit na tři nové expozice – Národní expozici vinařství, expozici Tajemný život v půdě a nové zpracování stávající expozice Krajina Lednicko-valtického areálu. Modernizací areálu se také výrazně zlepší podmínky pro uchovávání sbírkových předmětů v depozitářích. Vznikne efektivnější systém jejich ukládání, zlepší se tepelné a vlhkostní podmínky, dojde k odstranění havarijních technických podmínek, jako je například zatékání stropu. Sbírkové předměty budou lépe zabezpečeny také z hlediska požární ochrany, ochrany proti odcizení a před neoprávněnou manipulací. „Naše muzeum prochází skutečně velkou rekonstrukcí a procesem oživování, jak v hlavní výstavní budově v Praze na Letné, tak na pobočkách v regionech. Snažíme se vybudovat nové zázemí pro sbírkové předměty a především moderní a současné trendy naplňující expozice,“ říká generální ředitel Národního zemědělského muzea Milan Jan Půček. 

Rekonstrukcí projde také střecha budovy a podkroví, vznikne také malá expozice v půdních prostorách, které doposud nebyly zpřístupněny. Muzeum získá novou pavlač ve dvorní části druhého nadzemního podlaží. Součástí modernizace bude také zpřístupnění expozic pro návštěvníky s omezenou mobilitou, muzeum jim nabídne bezbariérový přístup a k lepšímu komfortu přispěje i vybudování výtahu. „Projekt by měl být ukončen v červnu 2019. Muzeum bude i v průběhu rekonstrukce otevřeno pro veřejnost, i když pouze v omezené podobě a za snížené vstupné, návštěvníci mohou zhlédnout expozici krajina Lednicko-valtického areálu,“ uvedl ředitel valtické pobočky Vilém Křeček.

Projekt Modernizace areálu a zefektivnění správy podsbírek Národního zemědělského muzea Valtice je financován z programu Integrovaného regionálního programu (IROP) Evropské unie a Ministerstvem zemědělství, které je zřizovatelem muzea. Díky zapojení do programů IROP vzniká také zcela nová pobočka Národního zemědělského muzea v Ostravě, depozitárně-expoziční objekt v areálu Dolních Vítkovic, a nový provozně nízkonákladový depozitář v Národním zemědělském muzeu Čáslav – muzeu zemědělské techniky.